徐々にその全貌を見せ始める怪物・キマイラと謎の特殊法人ＡＴＨＥＯＳ。宝生アイコの唯一の心の拠り所である調査員・須藤の悲しい過去。そして、光を求めて戦うほど深い闇に飲み込まれていくアイコの運命は？