突如人間を襲い始めた、堕天翅族を倒す為、神城ゆるぎは究極兵器アクエリオンのパイロット選抜試験に参加する。合格して過酷な訓練に励む彼は徐々に力を発揮。そんな折、正規パイロット達が全滅、戦場に出撃する事に